De bescherming als monument omvat het douanekantoor langs de Oostkaai.

Het beschermingsdossier motiveert de industrieel-archeologische waarde van het Douanegebouw als volgt: "Deze drie [Koninklijk Stapelhuis op de Westkaai van het Vlotdok, het Stapelhuis op de Oostkaai en het Douanegebouw] vormen een geheel van stijluniforme (neoclassicistische) industriële gebouwen gelegen aan het Vlotdok, in de onmiddellijke nabijheid van de 'de Smet de Naeyerbruggen'."