en wetenschappelijke, in casu natuurwetenschappelijke waarde: Het landschap van de Leiemeersen weerspiegelt de evolutie van een riviervlakte sedert het laat-glaciaal tot op heden. Natuurwetenschappelijk is het een duidelijk gestructureerd gebied dat zeer gevarieerd is, zowel geomorfologisch, bodemkundig, geografisch als floristisch. Vele elementen zijn als relicten herkenbaar (oeverwal, komgrond, pleistocene donk, duinvoet), en bezitten een belangrijke wetenschappelijke informatiewaarde. Dergelijke rivierlandschappen komen in Vlaanderen nog maar weinig voor. Gezien de verstedelijkingsdruk in het gebied is een rangschikking van deze relicten belangrijk.
Alhoewel zeer sterk door de mens beïnvloed vertoont de vegetatie nog altijd interessante aspecten: lokaal komen nog altijd op de meer vochtige bodems half-natuurlijke graslandfragmenten voor (hooiland en minder intensief begraasd weiland) met een zeldzame flora. Maar ook de drogere graslanden herbergen nog enkele interessante flora-elementen, vooral naar de perceelsranden toe.
De overgang tussen duinen en meersen wordt plaatselijk getypeerd door een zone waar zuur kwelwater uit de bodem sijpelt en waar onder meer beschermde plantensoorten zoals veenmossen groeien.
De waterplantenvegetaties van grachten en poelen zijn nog soortenrijk en omvatten enkele - landelijk gezien - zeldzame tot zeer zeldzame soorten.

en historische, in casu cultuurhistorische waarde: De meersgebieden zijn belangrijke getuigen van de historisch-geografische ontwikkeling in de rivierlandschappen, in het bijzonder wat de vroege landbouworganisatie betreft. Van de grote Vlaamse rivierlandschappen zijn hiervan nog maar weinig voorbeelden bewaard gebleven: de Leiemeersen te Sint-Martens-Latem behoren hiertoe.
Dit Leielandschap heeft bovendien een belangrijke cultuurhistorische betekenis met betrekking tot de Latemse schilderschool, wat van nationaal belang is.