Aimé Hooghuys, zoon van Louis-Benoit, berichtte in 1885 bij het overlijden van zijn vader, dat hij als enige (d.w.z. zonder zijn broer-orgelbouwer) het ouderlijk bedrijf zou verderzetten en dat de werkplaats overgebracht werd van de Sint-Jacobsstraat naar de Kartuizerinnenstraat in Brugge. Van Aimé Hooghuys zijn hoofdzakelijk herstellingen en verbouwingen aan orgels bekend; blijkbaar slaagde hij er niet in hetzelfde hoog niveau als bij zijn vader te handhaven.