De pastoor van Izenberge kocht in 1818 een orgel van een privé-persoon; misschien betrof het een instrument dat tijdens de Franse Revolutie-periode openbaar verkocht was geweest; de herkomst is niet bekend. In 1823 werd dit orgel gerenoveerd door orgelmaker B. De Gryse (Wervik); later (circa 1830?) voegde Fr. Liem (Izenberge) nog pijpwerk toe. In 1848-1868, onderhoud door P.A. Loncke (Hoogstade); H. Waeles, koster-organist, trachtte in 1905 het orgel te vergroten tot een 2-klaviers, door het binnenwerk uit het orgel van de kapel van Izenberge toe te voegen aan het orgel van de kerk. Het orgel in zijn huidige vorm is te beschouwen als een instrument van de firma J. Loncke en Zonen (Esen), met verwerking van het vóór 1969 in de kerk aanwezige pijpwerk.