Een orgel, afkomstig uit het Rijke Klaren-klooster in Brugge, en waarschijnlijk met nog hoge erfgoedwaarde, ging verloren in de Eerste Wereldoorlog. In de Interbellum-periode was er vermoedelijk geen orgel aanwezig. In 1951 werd op het West-doksaal een nieuw orgel gebouwd door Jos. en P. Loncke (Esen). Rond 2007 werd ook het Busschaert-orgel uit de voorgoed gesloten parochiekerk van Bossuit overgeplaatst naar de kerk van Koolskamp, als koororgel.