De Kortrijkse hoofdkerk Sint-Maarten (die overigens tot 1785 de enige parochiekerk was in de stad) heeft als vanzelfsprekend een zeer rijke orgelgeschiedenis, reeds van in 1414: zowat alle namen van belangrijke Vlaamse orgelbouwers zijn hier aan te treffen (Langhedul, Carlier, Isoree, Medaert, Frémat, De Rijckere ...). In 1854 bouwde P.A. van Dinter een nieuw orgel, dat echter reeds in 1862 verloren ging in de brand van de kerktoren.

In 1886-1887 werd een groot nieuw orgel in romantisch-symfonische stijl gebouwd door P. Schyven. Het instrument onderging in het begin van de 20ste eeuw een lichte dispositiewijziging. In 1954 werd het ingrijpend geremoderniseerd door J. Loncke, maar het meeste Schyven-materiaal (windladen, pijpen ...) werd toch behouden.

Koororgel: in de voet van het hoogaltaar werd in 1968 een klein begeleidingsorgel gebouwd door de firma Loncke.