De huidige parochiekerk werd in twee fases opgetrokken tussen 1843 en 1872. In de 13de eeuw werd de kerk verbouwd en op 16 oktober 1576 werd ze door de Spaanse troepen in brand gestoken. Pas na de herovering van het Waasland door Alexander Farnese, eind 1583, konden de nodige herstellingswerken uitgevoerd worden. In de 17de en 18de eeuw werd de kerk verbouwd in barokstijl. Achtereenvolgens werden een Onze-Lieve-Vrouwekoor (1666), zuidelijke zijbeuk (1674-1681), westgevel (1719) en een sacristie (1731) opgetrokken. Op hetzelfde ogenblik volgde een verdere (her-)inrichting van de kerk.

In de 19de-eeuw was Haasdonk getuige van een belangrijke bevolkingsaanwas. Dat noopte het kerkbestuur tot een vergroting van de kerk. In de praktijk werd de oude kerk overbouwd waarna ze afgebroken werd. Op historische kaarten is zowel de kerk als het kerkhof errond zichtbaar. Via toevalsvondsten werden al menselijke resten gerecupereerd. Bij het graven van een sleuf voor nutsleidingen werden in de bovenste pakketten fragmenten menselijk botmateriaal aangetroffen.