Voorafgaandelijk aan de geplande afbraak van de hoeve Maurice en Victorine Boydens in functie van natuurherstel werd de schuur waarvan geweten is dat ze bovenop de laatmiddeleeuwse kapel van Walraversijde is gebouwd aan een bouwhistorisch onderzoek onderworpen. Het was immers niet
helemaal uit te sluiten dat de schuur nog onderdelen van de voormalige kapel in opstand bevatte. Het bouwkundig onderzoek wees echter uit dat in de schuur die zou afgebroken worden geen sporen van de laatmiddeleeuwse kapeltoren aanwezig waren. De schuur die in 2020 is afgebroken was dus een volledige nieuwbouw na WO II. De afbraak van de hoeve Maurice en Victorine Boydens eind 2020, bracht wel eerder onverwacht toch de funderingen van de laatmiddeleeuwse kapeltoren van Walraversijde aan het licht. Deze funderingen en de eraan gekoppelde sporen werden op 14 en 15 december 2020 – na het melden van een toevalsvondst - op het terrein in detail onderzocht.

Het onderzoek bracht een zeer robuuste fundering van een kapeltoren die buitenwerks ongeveer 5 m bij 5 m mat aan het licht. De hoeken van de vierkante structuur vertoonden waar ze goed konden onderzocht worden steunberen. Aan weerszijden waren structuren tegen de kapeltoren aangebouwd en in beide zijden was een deuropening gemaakt waarvan er wellicht slechts 1 tot de conceptfase van de kapeltoren terug gaat. Aan één zijde was de vierkante ruimte niet met een zware fundering afgebakend, wellicht dus de zijde van het schip van de kapel. Al die kenmerken samen maken dat de waargenomen archeologische sporen zeer goed overeenstemmen met de meest iconische afbeelding van de kapeltoren en dat we deze als behorende tot de kapel kunnen identificeren. Deze afbeelding toont de vierkante toren, de steunberen op de hoeken, aanbouwsels aan twee zijden en een grote deuropening, wellicht de opening naar het schip van de kapel. Vermits er geen verdere bodemarchiefbedreigende activiteiten werden gepland is geopteerd om de vrijgekomen sporen enkel te documenteren zoals ze zichtbaar waren wel met enkele beperkte steekproeven. Het bij dit onderzoek ingezamelde vondstenmateriaal geeft dus ook aan dat we niet dieper dan de 2de helft van de 17de eeuw zijn afgedaald in de historiek van deze site.